Szkoła Podstawowa Fundacji EKOS w Swarzędzu powstała z przekształcenia w 2017 r. niepublicznego Gimnazjum nr 1 w Swarzędzu, szkoły prowadzonej od 1998 r. przez Fundację Edukacji Społecznej EKOS. Solidny poziom nauczania w Gimnazjum znajdował zawsze potwierdzenie i w wynikach uzyskiwanych przez uczniów na egzaminach gimnazjalnych, od lat jednych z najlepszych w Wielkopolsce i okręgu. W ramach projektu CKE - badania Edukacyjnej Wartości Dodanej, Gimnazjum uzyskało miano "szkoły sukcesu".